A EEMT localiza-se no Parque Natural da Ria Formosa, em Vale de Caranguejo, em frente ao Forte do Rato. A EEMT constitui uma unidade de investigação do Instituto Português do Mar e da Atmosfera – IPMA, I.P., dedicada a duas áreas principais: 1) produção de bivalves (amêijoas, ostras, entre outros); 2) geociências marinhas.

A investigação científica é financiada por vários projectos no âmbito de programas nacionais e internacionais. A EEMT desempenha um papel importante junto das comunidades locais e regionais através da transferência de tecnologia ao setor produtivo da moluscicultura e apoio a empresas (start-ups). Está também fortemente envolvida na promoção e dinamização de atividades das ciências do mar junto das escolas e do público em geral e colabora ainda na formação científica e técnica quer a nível profissional quer universitário.